Changes

              
    

          
          
        
        

            
f
1
{
f
1
{
            
2
  "author": "Ern, Rasmus",
2
  "author": "Ern, Rasmus",
            
3
  "author_email": "",
3
  "author_email": "",
            
4
  "citation": [],
4
  "citation": [],
            
5
  "creator_user_id": "17755db4-395a-4b3b-ac09-e8e3484ca700",
5
  "creator_user_id": "17755db4-395a-4b3b-ac09-e8e3484ca700",
            
6
  "doi": "10.1594/PANGAEA.869471",
6
  "doi": "10.1594/PANGAEA.869471",
            
7
  "doi_date_published": "2016",
7
  "doi_date_published": "2016",
            
8
  "doi_publisher": "",
8
  "doi_publisher": "",
            
9
  "doi_status": "True",
9
  "doi_status": "True",
            
10
  "extra_authors": [
10
  "extra_authors": [
            
11
    {
11
    {
            
12
      "extra_author": "Esbaugh, Andrew J",
12
      "extra_author": "Esbaugh, Andrew J",
            
13
      "familyName": "Esbaugh",
13
      "familyName": "Esbaugh",
            
14
      "givenName": "Andrew J",
14
      "givenName": "Andrew J",
            
15
      "orcid": ""
15
      "orcid": ""
            
16
    }
16
    }
            
17
  ],
17
  ],
            
18
  "familyName": "Ern",
18
  "familyName": "Ern",
            
19
  "givenName": "Rasmus",
19
  "givenName": "Rasmus",
            
20
  "groups": [],
20
  "groups": [],
            
21
  "id": "24ccde85-01a4-43f7-ad78-b72220b5f34e",
21
  "id": "24ccde85-01a4-43f7-ad78-b72220b5f34e",
            
22
  "isopen": false,
22
  "isopen": false,
            
23
  "license_id": "CC-BY-3.0",
23
  "license_id": "CC-BY-3.0",
            
24
  "license_title": "CC-BY-3.0",
24
  "license_title": "CC-BY-3.0",
            
25
  "metadata_created": "2024-11-29T11:45:46.088366",
25
  "metadata_created": "2024-11-29T11:45:46.088366",
            
n
26
  "metadata_modified": "2024-11-29T11:45:46.088371",
n
26
  "metadata_modified": "2024-11-30T14:31:09.788627",
            
27
  "name": "png-doi-10-1594-pangaea-869471",
27
  "name": "png-doi-10-1594-pangaea-869471",
            
28
  "notes": "Hyperventilation is a common response in fish exposed to 
28
  "notes": "Hyperventilation is a common response in fish exposed to 
            
29
elevated water CO2. It is believed to lessen the respiratory acidosis 
29
elevated water CO2. It is believed to lessen the respiratory acidosis 
            
30
associated with hypercapnia by lowering arterial PCO2, but the 
30
associated with hypercapnia by lowering arterial PCO2, but the 
            
31
contribution of hyperventilation to blood acid-base compensation has 
31
contribution of hyperventilation to blood acid-base compensation has 
            
32
yet to be quantified. Hyperventilation may also increase the flux of 
32
yet to be quantified. Hyperventilation may also increase the flux of 
            
33
irons across the gill epithelium and the cost of osmoregulation, owing 
33
irons across the gill epithelium and the cost of osmoregulation, owing 
            
34
to the osmo-respiratory compromise. Therefore, hypercapnia exposed 
34
to the osmo-respiratory compromise. Therefore, hypercapnia exposed 
            
35
fish may increase standard metabolic rate (SMR) leaving less energy 
35
fish may increase standard metabolic rate (SMR) leaving less energy 
            
36
for physiological functions such as foraging, migration, growth and 
36
for physiological functions such as foraging, migration, growth and 
            
37
reproduction. Here we show that gill ventilation, blood PCO2 and total 
37
reproduction. Here we show that gill ventilation, blood PCO2 and total 
            
38
blood [CO2] increased in red drum (Sciaenops ocellatus) exposed to 
38
blood [CO2] increased in red drum (Sciaenops ocellatus) exposed to 
            
39
1000 and 5000 \u00b5atm water CO2, and that blood PCO2 and total blood 
39
1000 and 5000 \u00b5atm water CO2, and that blood PCO2 and total blood 
            
40
[CO2] decrease in fish during hypoxia induced hyperventilation. Based 
40
[CO2] decrease in fish during hypoxia induced hyperventilation. Based 
            
41
on these results we estimate the ventilatory contributions to total 
41
on these results we estimate the ventilatory contributions to total 
            
42
acid-base compensation in 1000 and 5000 \u00b5atm water CO2. We find 
42
acid-base compensation in 1000 and 5000 \u00b5atm water CO2. We find 
            
43
that S. ocellatus only utilize a portion of its ventilatory capacity 
43
that S. ocellatus only utilize a portion of its ventilatory capacity 
            
44
to reduce the acid-base disturbance in 1000 \u00b5atm water CO2. SMR 
44
to reduce the acid-base disturbance in 1000 \u00b5atm water CO2. SMR 
            
45
was unaffected by both salinity and hypercapnia exposure indicating 
45
was unaffected by both salinity and hypercapnia exposure indicating 
            
46
that the cost of osmoregulation is small relative to SMR, and that the 
46
that the cost of osmoregulation is small relative to SMR, and that the 
            
47
lack of increased ventilation in 1000 \u00b5atm water CO2 despite the 
47
lack of increased ventilation in 1000 \u00b5atm water CO2 despite the 
            
48
capacity to do so is not due to an energetic tradeoff between 
48
capacity to do so is not due to an energetic tradeoff between 
            
49
acid-base balance and osmoregulation. Therefore, while ocean 
49
acid-base balance and osmoregulation. Therefore, while ocean 
            
50
acidification may impact ventilatory parameters, there will be little 
50
acidification may impact ventilatory parameters, there will be little 
            
51
impact on the overall energy budget of S. ocellatus.",
51
impact on the overall energy budget of S. ocellatus.",
            
52
  "num_resources": 0,
52
  "num_resources": 0,
            
n
53
  "num_tags": 12,
n
53
  "num_tags": 13,
            
54
  "orcid": "0000-0002-4202-476X",
54
  "orcid": "0000-0002-4202-476X",
            
55
  "organization": {
55
  "organization": {
            
56
    "approval_status": "approved",
56
    "approval_status": "approved",
            
n
57
    "created": "2024-11-29T11:32:00.143130",
n
57
    "created": "2024-11-30T14:19:14.458899",
            
58
    "description": "PANGAEA (Data Publisher for Earth & Environmental 
58
    "description": "PANGAEA (Data Publisher for Earth & Environmental 
            
59
Science): The information system PANGAEA is operated as an Open Access 
59
Science): The information system PANGAEA is operated as an Open Access 
            
60
library aimed at archiving, publishing and distributing georeferenced 
60
library aimed at archiving, publishing and distributing georeferenced 
            
61
data from earth system research. PANGAEA guarantees long-term 
61
data from earth system research. PANGAEA guarantees long-term 
            
62
availability (greater than 10 years) of its content. PANGAEA is open 
62
availability (greater than 10 years) of its content. PANGAEA is open 
            
63
to any project, institution, or individual scientist to use or to 
63
to any project, institution, or individual scientist to use or to 
            
64
archive and publish data. PANGAEA focuses on georeferenced 
64
archive and publish data. PANGAEA focuses on georeferenced 
            
65
observational data, experimental data, and models/simulations. 
65
observational data, experimental data, and models/simulations. 
            
66
Citability, comprehensive metadata descriptions, interoperability of 
66
Citability, comprehensive metadata descriptions, interoperability of 
            
67
data and metadata, a high degree of structural and semantic 
67
data and metadata, a high degree of structural and semantic 
            
68
harmonization of the data inventory as well as the commitment of the 
68
harmonization of the data inventory as well as the commitment of the 
            
69
hosting institutions ensures FAIRness of archived data.",
69
hosting institutions ensures FAIRness of archived data.",
            
n
70
    "id": "3226ef9c-20d1-43fd-ba8f-fa35c8c9fb5d",
n
70
    "id": "e4c6c709-6080-430f-8979-e57014b1b0ee",
            
71
    "image_url": "pangaea_topicbiosphere.png",
71
    "image_url": "pangaea_topicbiologicalclassification.png",
            
72
    "is_organization": true,
72
    "is_organization": true,
            
n
73
    "name": "pangaea_biosphere",
n
73
    "name": "pangaea_biologicalclassification",
            
74
    "state": "active",
74
    "state": "active",
            
n
75
    "title": "PANGAEA (Biosphere)",
n
75
    "title": "PANGAEA (Biological Classification)",
            
76
    "type": "organization"
76
    "type": "organization"
            
77
  },
77
  },
            
n
78
  "owner_org": "3226ef9c-20d1-43fd-ba8f-fa35c8c9fb5d",
n
78
  "owner_org": "e4c6c709-6080-430f-8979-e57014b1b0ee",
            
79
  "private": false,
79
  "private": false,
            
80
  "publication_year": "2016",
80
  "publication_year": "2016",
            
81
  "related_identifiers": [
81
  "related_identifiers": [
            
82
    {
82
    {
            
83
      "authors": "Ern Rasmus,Esbaugh Andrew J",
83
      "authors": "Ern Rasmus,Esbaugh Andrew J",
            
84
      "email_authors": "work@rasmusern.dk,",
84
      "email_authors": "work@rasmusern.dk,",
            
85
      "identifier": "https://doi.org/10.1007/s00360-016-0971-7",
85
      "identifier": "https://doi.org/10.1007/s00360-016-0971-7",
            
86
      "identifier_type": "DOI",
86
      "identifier_type": "DOI",
            
87
      "orcid_authors": "0000-0002-4202-476X,",
87
      "orcid_authors": "0000-0002-4202-476X,",
            
88
      "relation_type": "IsSupplementTo",
88
      "relation_type": "IsSupplementTo",
            
89
      "source": "Journal of Comparative Physiology B-Biochemical 
89
      "source": "Journal of Comparative Physiology B-Biochemical 
            
90
Systemic and Environmentalphysiology",
90
Systemic and Environmentalphysiology",
            
91
      "title": "Hyperventilation and blood acid\u2013base balance in 
91
      "title": "Hyperventilation and blood acid\u2013base balance in 
            
92
hypercapnia exposed red drum (Sciaenops ocellatus)",
92
hypercapnia exposed red drum (Sciaenops ocellatus)",
            
93
      "year": "2016"
93
      "year": "2016"
            
94
    },
94
    },
            
95
    {
95
    {
            
96
      "authors": "Gattuso Jean-Pierre,Epitalon Jean-Marie,Lavigne 
96
      "authors": "Gattuso Jean-Pierre,Epitalon Jean-Marie,Lavigne 
            
97
H\u00e9lo\u00efse,Orr James C,Gentili Bernard,Proye 
97
H\u00e9lo\u00efse,Orr James C,Gentili Bernard,Proye 
            
98
Aur\u00e9lien,Soetaert Karline,Rae James",
98
Aur\u00e9lien,Soetaert Karline,Rae James",
            
99
      "email_authors": 
99
      "email_authors": 
            
100
,j.orr@iaea.org,bernard.gentili@orange.fr,,karline.soetaert@nioz.nl,",
100
,j.orr@iaea.org,bernard.gentili@orange.fr,,karline.soetaert@nioz.nl,",
            
101
      "identifier": "https://cran.r-project.org/package=seacarb",
101
      "identifier": "https://cran.r-project.org/package=seacarb",
            
102
      "identifier_type": "DOI",
102
      "identifier_type": "DOI",
            
103
      "orcid_authors": 
103
      "orcid_authors": 
            
104
4114,,,0000-0002-8707-7080,,,0000-0003-4603-7100,0000-0003-3904-2526",
104
4114,,,0000-0002-8707-7080,,,0000-0003-4603-7100,0000-0003-3904-2526",
            
105
      "relation_type": "References",
105
      "relation_type": "References",
            
106
      "source": "",
106
      "source": "",
            
107
      "title": "seacarb: seawater carbonate chemistry with R. R 
107
      "title": "seacarb: seawater carbonate chemistry with R. R 
            
108
package version 3.1",
108
package version 3.1",
            
109
      "year": "2016"
109
      "year": "2016"
            
110
    }
110
    }
            
111
  ],
111
  ],
            
112
  "relationships_as_object": [],
112
  "relationships_as_object": [],
            
113
  "relationships_as_subject": [],
113
  "relationships_as_subject": [],
            
114
  "repository_name": "PANGAEA (Data Publisher for Earth & 
114
  "repository_name": "PANGAEA (Data Publisher for Earth & 
            
115
Environmental Science)",
115
Environmental Science)",
            
116
  "resource_type": "text/tab-separated-values - filename: 
116
  "resource_type": "text/tab-separated-values - filename: 
            
117
Ern-Esbaugh_2016",
117
Ern-Esbaugh_2016",
            
118
  "resources": [],
118
  "resources": [],
            
119
  "source_metadata_created": "2016",
119
  "source_metadata_created": "2016",
            
120
  "source_metadata_modified": "",
120
  "source_metadata_modified": "",
            
121
  "state": "active",
121
  "state": "active",
            
122
  "subject_areas": [
122
  "subject_areas": [
            
123
    {
123
    {
            
124
      "subject_area_additional": "",
124
      "subject_area_additional": "",
            
125
      "subject_area_name": "BiologicalClassification"
125
      "subject_area_name": "BiologicalClassification"
            
126
    },
126
    },
            
127
    {
127
    {
            
128
      "subject_area_additional": "",
128
      "subject_area_additional": "",
            
129
      "subject_area_name": "Biosphere"
129
      "subject_area_name": "Biosphere"
            
130
    },
130
    },
            
131
    {
131
    {
            
132
      "subject_area_additional": "",
132
      "subject_area_additional": "",
            
133
      "subject_area_name": "Chemistry"
133
      "subject_area_name": "Chemistry"
            
134
    }
134
    }
            
135
  ],
135
  ],
            
136
  "tags": [
136
  "tags": [
            
137
    {
137
    {
            
n
n
138
      "display_name": "1000 L or  1 m2",
            
139
      "id": "d920ecdb-c44e-43f2-bb4c-ffdc3a3c398c",
            
140
      "name": "1000 L or  1 m2",
            
141
      "state": "active",
            
142
      "vocabulary_id": null
            
143
    },
            
144
    {
            
138
      "display_name": "Animalia",
145
      "display_name": "Animalia",
            
139
      "id": "e645e194-a2f7-40f1-ae7c-c1496be6f6bf",
146
      "id": "e645e194-a2f7-40f1-ae7c-c1496be6f6bf",
            
140
      "name": "Animalia",
147
      "name": "Animalia",
            
141
      "state": "active",
148
      "state": "active",
            
142
      "vocabulary_id": null
149
      "vocabulary_id": null
            
143
    },
150
    },
            
144
    {
151
    {
            
145
      "display_name": "Behaviour",
152
      "display_name": "Behaviour",
            
146
      "id": "997ae82e-dd3f-414b-8131-7288c916ef2b",
153
      "id": "997ae82e-dd3f-414b-8131-7288c916ef2b",
            
147
      "name": "Behaviour",
154
      "name": "Behaviour",
            
148
      "state": "active",
155
      "state": "active",
            
149
      "vocabulary_id": null
156
      "vocabulary_id": null
            
150
    },
157
    },
            
151
    {
158
    {
            
152
      "display_name": "Chordata",
159
      "display_name": "Chordata",
            
153
      "id": "26be37c5-268c-4a0d-a4c0-821366ed33f0",
160
      "id": "26be37c5-268c-4a0d-a4c0-821366ed33f0",
            
154
      "name": "Chordata",
161
      "name": "Chordata",
            
155
      "state": "active",
162
      "state": "active",
            
156
      "vocabulary_id": null
163
      "vocabulary_id": null
            
157
    },
164
    },
            
158
    {
165
    {
            
159
      "display_name": "Coast and continental shelf",
166
      "display_name": "Coast and continental shelf",
            
160
      "id": "58eb1929-34b5-4fd9-ac44-824f0e51de40",
167
      "id": "58eb1929-34b5-4fd9-ac44-824f0e51de40",
            
161
      "name": "Coast and continental shelf",
168
      "name": "Coast and continental shelf",
            
162
      "state": "active",
169
      "state": "active",
            
163
      "vocabulary_id": null
170
      "vocabulary_id": null
            
164
    },
171
    },
            
165
    {
172
    {
            
t
166
      "display_name": "Containers and aquaria 20-1000 L or  1 m2",
t
173
      "display_name": "Containers and aquaria 20",
            
167
      "id": "a9d9036d-3fe8-4fb1-bcb9-07b8a3a3fe11",
174
      "id": "18d57eca-7aec-4d8a-9a57-92bf32a45d53",
            
168
      "name": "Containers and aquaria 20-1000 L or  1 m2",
175
      "name": "Containers and aquaria 20",
            
169
      "state": "active",
176
      "state": "active",
            
170
      "vocabulary_id": null
177
      "vocabulary_id": null
            
171
    },
178
    },
            
172
    {
179
    {
            
173
      "display_name": "Laboratory experiment",
180
      "display_name": "Laboratory experiment",
            
174
      "id": "c6c00754-c769-4932-a517-bff2c9512884",
181
      "id": "c6c00754-c769-4932-a517-bff2c9512884",
            
175
      "name": "Laboratory experiment",
182
      "name": "Laboratory experiment",
            
176
      "state": "active",
183
      "state": "active",
            
177
      "vocabulary_id": null
184
      "vocabulary_id": null
            
178
    },
185
    },
            
179
    {
186
    {
            
180
      "display_name": "Nekton",
187
      "display_name": "Nekton",
            
181
      "id": "524e0e76-b413-4cb3-9367-6d747b0ddaa9",
188
      "id": "524e0e76-b413-4cb3-9367-6d747b0ddaa9",
            
182
      "name": "Nekton",
189
      "name": "Nekton",
            
183
      "state": "active",
190
      "state": "active",
            
184
      "vocabulary_id": null
191
      "vocabulary_id": null
            
185
    },
192
    },
            
186
    {
193
    {
            
187
      "display_name": "North Atlantic",
194
      "display_name": "North Atlantic",
            
188
      "id": "72c150cb-b0a4-479b-a0c5-f23ebb039ab7",
195
      "id": "72c150cb-b0a4-479b-a0c5-f23ebb039ab7",
            
189
      "name": "North Atlantic",
196
      "name": "North Atlantic",
            
190
      "state": "active",
197
      "state": "active",
            
191
      "vocabulary_id": null
198
      "vocabulary_id": null
            
192
    },
199
    },
            
193
    {
200
    {
            
194
      "display_name": "Pelagos",
201
      "display_name": "Pelagos",
            
195
      "id": "012f5b69-4e75-4f54-8ac4-8bf192cafaa2",
202
      "id": "012f5b69-4e75-4f54-8ac4-8bf192cafaa2",
            
196
      "name": "Pelagos",
203
      "name": "Pelagos",
            
197
      "state": "active",
204
      "state": "active",
            
198
      "vocabulary_id": null
205
      "vocabulary_id": null
            
199
    },
206
    },
            
200
    {
207
    {
            
201
      "display_name": "Sciaenops ocellatus",
208
      "display_name": "Sciaenops ocellatus",
            
202
      "id": "cdff11e7-5e2a-40e6-afe9-4dd131077fb4",
209
      "id": "cdff11e7-5e2a-40e6-afe9-4dd131077fb4",
            
203
      "name": "Sciaenops ocellatus",
210
      "name": "Sciaenops ocellatus",
            
204
      "state": "active",
211
      "state": "active",
            
205
      "vocabulary_id": null
212
      "vocabulary_id": null
            
206
    },
213
    },
            
207
    {
214
    {
            
208
      "display_name": "Single species",
215
      "display_name": "Single species",
            
209
      "id": "88de69be-3bdd-4cf8-b6a1-386d72c5888d",
216
      "id": "88de69be-3bdd-4cf8-b6a1-386d72c5888d",
            
210
      "name": "Single species",
217
      "name": "Single species",
            
211
      "state": "active",
218
      "state": "active",
            
212
      "vocabulary_id": null
219
      "vocabulary_id": null
            
213
    },
220
    },
            
214
    {
221
    {
            
215
      "display_name": "Temperate",
222
      "display_name": "Temperate",
            
216
      "id": "31aaeb0c-a4a5-4a8e-9c90-be1eff0cac91",
223
      "id": "31aaeb0c-a4a5-4a8e-9c90-be1eff0cac91",
            
217
      "name": "Temperate",
224
      "name": "Temperate",
            
218
      "state": "active",
225
      "state": "active",
            
219
      "vocabulary_id": null
226
      "vocabulary_id": null
            
220
    }
227
    }
            
221
  ],
228
  ],
            
222
  "title": "Hyperventilation and blood acid-base balance in 
229
  "title": "Hyperventilation and blood acid-base balance in 
            
223
hypercapnia exposed red drum (Sciaenops ocellatus)",
230
hypercapnia exposed red drum (Sciaenops ocellatus)",
            
224
  "type": "vdataset",
231
  "type": "vdataset",
            
225
  "url": "https://doi.org/10.1594/PANGAEA.869471"
232
  "url": "https://doi.org/10.1594/PANGAEA.869471"
            
226
}
233
}