Changes

              
    

          
          
        
        

            
f
1
{
f
1
{
            
2
  "author": "Tait, Karen",
2
  "author": "Tait, Karen",
            
3
  "author_email": "",
3
  "author_email": "",
            
4
  "citation": [],
4
  "citation": [],
            
5
  "creator_user_id": "17755db4-395a-4b3b-ac09-e8e3484ca700",
5
  "creator_user_id": "17755db4-395a-4b3b-ac09-e8e3484ca700",
            
6
  "doi": "10.1594/PANGAEA.956023",
6
  "doi": "10.1594/PANGAEA.956023",
            
7
  "doi_date_published": "2016",
7
  "doi_date_published": "2016",
            
8
  "doi_publisher": "",
8
  "doi_publisher": "",
            
9
  "doi_status": "True",
9
  "doi_status": "True",
            
10
  "extra_authors": [
10
  "extra_authors": [
            
11
    {
11
    {
            
12
      "extra_author": "Beesley, A",
12
      "extra_author": "Beesley, A",
            
13
      "familyName": "Beesley",
13
      "familyName": "Beesley",
            
14
      "givenName": "A",
14
      "givenName": "A",
            
15
      "orcid": ""
15
      "orcid": ""
            
16
    },
16
    },
            
17
    {
17
    {
            
18
      "extra_author": "Findlay, Helen S",
18
      "extra_author": "Findlay, Helen S",
            
19
      "familyName": "Findlay",
19
      "familyName": "Findlay",
            
20
      "givenName": "Helen S",
20
      "givenName": "Helen S",
            
21
      "orcid": ""
21
      "orcid": ""
            
22
    },
22
    },
            
23
    {
23
    {
            
24
      "extra_author": "McNeill, C L",
24
      "extra_author": "McNeill, C L",
            
25
      "familyName": "McNeill",
25
      "familyName": "McNeill",
            
26
      "givenName": "C L",
26
      "givenName": "C L",
            
27
      "orcid": ""
27
      "orcid": ""
            
28
    },
28
    },
            
29
    {
29
    {
            
30
      "extra_author": "Widdicombe, Stephen",
30
      "extra_author": "Widdicombe, Stephen",
            
31
      "familyName": "Widdicombe",
31
      "familyName": "Widdicombe",
            
32
      "givenName": "Stephen",
32
      "givenName": "Stephen",
            
33
      "orcid": ""
33
      "orcid": ""
            
34
    }
34
    }
            
35
  ],
35
  ],
            
36
  "familyName": "Tait",
36
  "familyName": "Tait",
            
37
  "givenName": "Karen",
37
  "givenName": "Karen",
            
38
  "groups": [],
38
  "groups": [],
            
39
  "id": "361b44da-b704-4af0-bcc1-84c3fe783ad1",
39
  "id": "361b44da-b704-4af0-bcc1-84c3fe783ad1",
            
40
  "isopen": false,
40
  "isopen": false,
            
41
  "license_id": "CC-BY-4.0",
41
  "license_id": "CC-BY-4.0",
            
42
  "license_title": "CC-BY-4.0",
42
  "license_title": "CC-BY-4.0",
            
43
  "metadata_created": "2024-11-29T12:09:10.280676",
43
  "metadata_created": "2024-11-29T12:09:10.280676",
            
n
44
  "metadata_modified": "2024-11-29T12:09:10.280682",
n
44
  "metadata_modified": "2024-12-01T16:35:50.834296",
            
45
  "name": "png-doi-10-1594-pangaea-956023",
45
  "name": "png-doi-10-1594-pangaea-956023",
            
46
  "notes": "The geological storage of carbon dioxide (CO2) is expected 
46
  "notes": "The geological storage of carbon dioxide (CO2) is expected 
            
47
to be an important component of future global carbon emission 
47
to be an important component of future global carbon emission 
            
48
mitigation, but there is a need to understand the impacts of a CO2 
48
mitigation, but there is a need to understand the impacts of a CO2 
            
49
leak on the marine environment and to develop monitoring protocols for 
49
leak on the marine environment and to develop monitoring protocols for 
            
50
leakage detection. In the present study, sediment cores were exposed 
50
leakage detection. In the present study, sediment cores were exposed 
            
51
to CO2-acidified seawater at one of five pH levels (8.0, 7.5, 7.0, 6.5 
51
to CO2-acidified seawater at one of five pH levels (8.0, 7.5, 7.0, 6.5 
            
52
and 6.0) for 10 weeks. A bloom of Spirulina sp. and diatoms appeared 
52
and 6.0) for 10 weeks. A bloom of Spirulina sp. and diatoms appeared 
            
53
on sediment surface exposed to pH 7.0 and 7.5 seawater. Quantitative 
53
on sediment surface exposed to pH 7.0 and 7.5 seawater. Quantitative 
            
54
PCR measurements of the abundance of 16S rRNA also indicated an 
54
PCR measurements of the abundance of 16S rRNA also indicated an 
            
55
increase to the abundance of microbial 16S rRNA within the pH 7.0 and 
55
increase to the abundance of microbial 16S rRNA within the pH 7.0 and 
            
56
7.5 treatments after 10 weeks incubation. More detailed analysis of 
56
7.5 treatments after 10 weeks incubation. More detailed analysis of 
            
57
the microbial communities from the pH 7.0, 7.5 and 8.0 treatments 
57
the microbial communities from the pH 7.0, 7.5 and 8.0 treatments 
            
58
confirmed an increase in the relative abundance of Spirulina sp. and 
58
confirmed an increase in the relative abundance of Spirulina sp. and 
            
59
Navicula sp. sequences, with changes to the relative abundance of 
59
Navicula sp. sequences, with changes to the relative abundance of 
            
60
major archaeal and bacterial groups also detected within the pH 7.0 
60
major archaeal and bacterial groups also detected within the pH 7.0 
            
61
treatment. A decreased flux of silicate from the sediment at this pH 
61
treatment. A decreased flux of silicate from the sediment at this pH 
            
62
was also detected. Monitoring for blooms of microphytobenthos may 
62
was also detected. Monitoring for blooms of microphytobenthos may 
            
63
prove useful as an indicator of CO2 leakage within coastal areas.",
63
prove useful as an indicator of CO2 leakage within coastal areas.",
            
64
  "num_resources": 0,
64
  "num_resources": 0,
            
n
65
  "num_tags": 8,
n
65
  "num_tags": 9,
            
66
  "orcid": "0000-0001-8137-6998",
66
  "orcid": "0000-0001-8137-6998",
            
67
  "organization": {
67
  "organization": {
            
68
    "approval_status": "approved",
68
    "approval_status": "approved",
            
n
69
    "created": "2024-11-29T11:32:00.143130",
n
69
    "created": "2024-12-01T14:59:59.225691",
            
70
    "description": "PANGAEA (Data Publisher for Earth & Environmental 
70
    "description": "PANGAEA (Data Publisher for Earth & Environmental 
            
71
Science): The information system PANGAEA is operated as an Open Access 
71
Science): The information system PANGAEA is operated as an Open Access 
            
72
library aimed at archiving, publishing and distributing georeferenced 
72
library aimed at archiving, publishing and distributing georeferenced 
            
73
data from earth system research. PANGAEA guarantees long-term 
73
data from earth system research. PANGAEA guarantees long-term 
            
74
availability (greater than 10 years) of its content. PANGAEA is open 
74
availability (greater than 10 years) of its content. PANGAEA is open 
            
75
to any project, institution, or individual scientist to use or to 
75
to any project, institution, or individual scientist to use or to 
            
76
archive and publish data. PANGAEA focuses on georeferenced 
76
archive and publish data. PANGAEA focuses on georeferenced 
            
77
observational data, experimental data, and models/simulations. 
77
observational data, experimental data, and models/simulations. 
            
78
Citability, comprehensive metadata descriptions, interoperability of 
78
Citability, comprehensive metadata descriptions, interoperability of 
            
79
data and metadata, a high degree of structural and semantic 
79
data and metadata, a high degree of structural and semantic 
            
80
harmonization of the data inventory as well as the commitment of the 
80
harmonization of the data inventory as well as the commitment of the 
            
81
hosting institutions ensures FAIRness of archived data.",
81
hosting institutions ensures FAIRness of archived data.",
            
n
82
    "id": "3226ef9c-20d1-43fd-ba8f-fa35c8c9fb5d",
n
82
    "id": "fdbbf7ae-a771-4842-ba63-13b8006b5b6d",
            
83
    "image_url": "pangaea_topicbiosphere.png",
83
    "image_url": "pangaea_topicchemistry.png",
            
84
    "is_organization": true,
84
    "is_organization": true,
            
n
85
    "name": "pangaea_biosphere",
n
85
    "name": "pangaea_chemistry",
            
86
    "state": "active",
86
    "state": "active",
            
n
87
    "title": "PANGAEA (Biosphere)",
n
87
    "title": "PANGAEA (Chemistry)",
            
88
    "type": "organization"
88
    "type": "organization"
            
89
  },
89
  },
            
n
90
  "owner_org": "3226ef9c-20d1-43fd-ba8f-fa35c8c9fb5d",
n
90
  "owner_org": "fdbbf7ae-a771-4842-ba63-13b8006b5b6d",
            
91
  "private": false,
91
  "private": false,
            
92
  "publication_year": "2016",
92
  "publication_year": "2016",
            
93
  "related_identifiers": [
93
  "related_identifiers": [
            
94
    {
94
    {
            
95
      "authors": "Tait Karen,Beesley A,Findlay Helen S,McNeill C 
95
      "authors": "Tait Karen,Beesley A,Findlay Helen S,McNeill C 
            
96
L,Widdicombe Stephen,Gattuso Jean-Pierre,Epitalon Jean-Marie,Lavigne 
96
L,Widdicombe Stephen,Gattuso Jean-Pierre,Epitalon Jean-Marie,Lavigne 
            
97
H\u00e9lo\u00efse,Orr James,Tait Karen",
97
H\u00e9lo\u00efse,Orr James,Tait Karen",
            
98
      "email_authors": 
98
      "email_authors": 
            
99
,,hlavigne@naturalsciences.be,James.Orr@lsce.ipsl.fr,ktait@pml.ac.uk",
99
,,hlavigne@naturalsciences.be,James.Orr@lsce.ipsl.fr,ktait@pml.ac.uk",
            
100
      "identifier": "https://doi.org/10.1093/femsec/fiv092",
100
      "identifier": "https://doi.org/10.1093/femsec/fiv092",
            
101
      "identifier_type": "DOI",
101
      "identifier_type": "DOI",
            
102
      "orcid_authors": 
102
      "orcid_authors": 
            
103
"0000-0001-8137-6998,,,,,0000-0002-4533-4114,,,,0000-0001-8137-6998",
103
"0000-0001-8137-6998,,,,,0000-0002-4533-4114,,,,0000-0001-8137-6998",
            
104
      "relation_type": "References",
104
      "relation_type": "References",
            
105
      "source": "FEMS Microbiology Ecology",
105
      "source": "FEMS Microbiology Ecology",
            
106
      "title": "Elevated CO 2 induces a bloom of microphytobenthos 
106
      "title": "Elevated CO 2 induces a bloom of microphytobenthos 
            
107
within a shell gravel mesocosm",
107
within a shell gravel mesocosm",
            
108
      "year": "2015"
108
      "year": "2015"
            
109
    },
109
    },
            
110
    {
110
    {
            
111
      "authors": "Tait Karen,Beesley A,Findlay Helen S,McNeill C 
111
      "authors": "Tait Karen,Beesley A,Findlay Helen S,McNeill C 
            
112
L,Widdicombe Stephen,Gattuso Jean-Pierre,Epitalon Jean-Marie,Lavigne 
112
L,Widdicombe Stephen,Gattuso Jean-Pierre,Epitalon Jean-Marie,Lavigne 
            
113
H\u00e9lo\u00efse,Orr James,Tait Karen",
113
H\u00e9lo\u00efse,Orr James,Tait Karen",
            
114
      "email_authors": 
114
      "email_authors": 
            
115
,,hlavigne@naturalsciences.be,James.Orr@lsce.ipsl.fr,ktait@pml.ac.uk",
115
,,hlavigne@naturalsciences.be,James.Orr@lsce.ipsl.fr,ktait@pml.ac.uk",
            
116
      "identifier": 
116
      "identifier": 
            
117
"https://cran.r-project.org/web/packages/seacarb/index.html",
117
"https://cran.r-project.org/web/packages/seacarb/index.html",
            
118
      "identifier_type": "DOI",
118
      "identifier_type": "DOI",
            
119
      "orcid_authors": 
119
      "orcid_authors": 
            
120
"0000-0001-8137-6998,,,,,0000-0002-4533-4114,,,,0000-0001-8137-6998",
120
"0000-0001-8137-6998,,,,,0000-0002-4533-4114,,,,0000-0001-8137-6998",
            
121
      "relation_type": "References",
121
      "relation_type": "References",
            
122
      "source": "",
122
      "source": "",
            
123
      "title": "seacarb: seawater carbonate chemistry with R. R 
123
      "title": "seacarb: seawater carbonate chemistry with R. R 
            
124
package version 3.2.16",
124
package version 3.2.16",
            
125
      "year": "2021"
125
      "year": "2021"
            
126
    },
126
    },
            
127
    {
127
    {
            
128
      "authors": "Tait Karen,Beesley A,Findlay Helen S,McNeill C 
128
      "authors": "Tait Karen,Beesley A,Findlay Helen S,McNeill C 
            
129
L,Widdicombe Stephen,Gattuso Jean-Pierre,Epitalon Jean-Marie,Lavigne 
129
L,Widdicombe Stephen,Gattuso Jean-Pierre,Epitalon Jean-Marie,Lavigne 
            
130
H\u00e9lo\u00efse,Orr James,Tait Karen",
130
H\u00e9lo\u00efse,Orr James,Tait Karen",
            
131
      "email_authors": 
131
      "email_authors": 
            
132
,,hlavigne@naturalsciences.be,James.Orr@lsce.ipsl.fr,ktait@pml.ac.uk",
132
,,hlavigne@naturalsciences.be,James.Orr@lsce.ipsl.fr,ktait@pml.ac.uk",
            
133
      "identifier": 
133
      "identifier": 
            
134
"https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJEB1669",
134
"https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJEB1669",
            
135
      "identifier_type": "DOI",
135
      "identifier_type": "DOI",
            
136
      "orcid_authors": 
136
      "orcid_authors": 
            
137
"0000-0001-8137-6998,,,,,0000-0002-4533-4114,,,,0000-0001-8137-6998",
137
"0000-0001-8137-6998,,,,,0000-0002-4533-4114,,,,0000-0001-8137-6998",
            
138
      "relation_type": "References",
138
      "relation_type": "References",
            
139
      "source": "European Nucleotide Archive",
139
      "source": "European Nucleotide Archive",
            
140
      "title": "Elevated CO2 induces a bloom of microphytobenthos",
140
      "title": "Elevated CO2 induces a bloom of microphytobenthos",
            
141
      "year": "2013"
141
      "year": "2013"
            
142
    }
142
    }
            
143
  ],
143
  ],
            
144
  "relationships_as_object": [],
144
  "relationships_as_object": [],
            
145
  "relationships_as_subject": [],
145
  "relationships_as_subject": [],
            
146
  "repository_name": "PANGAEA (Data Publisher for Earth & 
146
  "repository_name": "PANGAEA (Data Publisher for Earth & 
            
147
Environmental Science)",
147
Environmental Science)",
            
148
  "resource_type": "text/tab-separated-values - filename: 
148
  "resource_type": "text/tab-separated-values - filename: 
            
149
Tait-etal_2016_FEMS",
149
Tait-etal_2016_FEMS",
            
150
  "resources": [],
150
  "resources": [],
            
151
  "source_metadata_created": "2016",
151
  "source_metadata_created": "2016",
            
152
  "source_metadata_modified": "",
152
  "source_metadata_modified": "",
            
153
  "state": "active",
153
  "state": "active",
            
154
  "subject_areas": [
154
  "subject_areas": [
            
155
    {
155
    {
            
156
      "subject_area_additional": "",
156
      "subject_area_additional": "",
            
157
      "subject_area_name": "Biosphere"
157
      "subject_area_name": "Biosphere"
            
158
    },
158
    },
            
159
    {
159
    {
            
160
      "subject_area_additional": "",
160
      "subject_area_additional": "",
            
161
      "subject_area_name": "Chemistry"
161
      "subject_area_name": "Chemistry"
            
162
    }
162
    }
            
163
  ],
163
  ],
            
164
  "tags": [
164
  "tags": [
            
165
    {
165
    {
            
166
      "display_name": "Benthos",
166
      "display_name": "Benthos",
            
167
      "id": "55bc70f2-ff73-4d9a-89f6-16358d0d9b87",
167
      "id": "55bc70f2-ff73-4d9a-89f6-16358d0d9b87",
            
168
      "name": "Benthos",
168
      "name": "Benthos",
            
169
      "state": "active",
169
      "state": "active",
            
170
      "vocabulary_id": null
170
      "vocabulary_id": null
            
171
    },
171
    },
            
172
    {
172
    {
            
173
      "display_name": "Coast and continental shelf",
173
      "display_name": "Coast and continental shelf",
            
174
      "id": "58eb1929-34b5-4fd9-ac44-824f0e51de40",
174
      "id": "58eb1929-34b5-4fd9-ac44-824f0e51de40",
            
175
      "name": "Coast and continental shelf",
175
      "name": "Coast and continental shelf",
            
176
      "state": "active",
176
      "state": "active",
            
177
      "vocabulary_id": null
177
      "vocabulary_id": null
            
178
    },
178
    },
            
179
    {
179
    {
            
180
      "display_name": "Community composition and diversity",
180
      "display_name": "Community composition and diversity",
            
181
      "id": "7579ffcb-0715-49e4-b2d3-fddd764ef3be",
181
      "id": "7579ffcb-0715-49e4-b2d3-fddd764ef3be",
            
182
      "name": "Community composition and diversity",
182
      "name": "Community composition and diversity",
            
183
      "state": "active",
183
      "state": "active",
            
184
      "vocabulary_id": null
184
      "vocabulary_id": null
            
185
    },
185
    },
            
186
    {
186
    {
            
187
      "display_name": "Entire community",
187
      "display_name": "Entire community",
            
188
      "id": "6e1a8708-bc7c-4fa2-af8d-8a3c7bf9112a",
188
      "id": "6e1a8708-bc7c-4fa2-af8d-8a3c7bf9112a",
            
189
      "name": "Entire community",
189
      "name": "Entire community",
            
190
      "state": "active",
190
      "state": "active",
            
191
      "vocabulary_id": null
191
      "vocabulary_id": null
            
192
    },
192
    },
            
193
    {
193
    {
            
194
      "display_name": "Laboratory experiment",
194
      "display_name": "Laboratory experiment",
            
195
      "id": "c6c00754-c769-4932-a517-bff2c9512884",
195
      "id": "c6c00754-c769-4932-a517-bff2c9512884",
            
196
      "name": "Laboratory experiment",
196
      "name": "Laboratory experiment",
            
197
      "state": "active",
197
      "state": "active",
            
198
      "vocabulary_id": null
198
      "vocabulary_id": null
            
199
    },
199
    },
            
200
    {
200
    {
            
201
      "display_name": "North Atlantic",
201
      "display_name": "North Atlantic",
            
202
      "id": "72c150cb-b0a4-479b-a0c5-f23ebb039ab7",
202
      "id": "72c150cb-b0a4-479b-a0c5-f23ebb039ab7",
            
203
      "name": "North Atlantic",
203
      "name": "North Atlantic",
            
204
      "state": "active",
204
      "state": "active",
            
205
      "vocabulary_id": null
205
      "vocabulary_id": null
            
206
    },
206
    },
            
207
    {
207
    {
            
n
208
      "display_name": "Soft-bottom community",
n
208
      "display_name": "Soft",
            
209
      "id": "7b1e2b88-0df6-4587-bded-47e31e4a1282",
209
      "id": "ef17379d-2638-4b73-9d0e-7b501f68c148",
            
210
      "name": "Soft-bottom community",
210
      "name": "Soft",
            
211
      "state": "active",
211
      "state": "active",
            
212
      "vocabulary_id": null
212
      "vocabulary_id": null
            
213
    },
213
    },
            
214
    {
214
    {
            
215
      "display_name": "Temperate",
215
      "display_name": "Temperate",
            
216
      "id": "31aaeb0c-a4a5-4a8e-9c90-be1eff0cac91",
216
      "id": "31aaeb0c-a4a5-4a8e-9c90-be1eff0cac91",
            
217
      "name": "Temperate",
217
      "name": "Temperate",
            
t
t
218
      "state": "active",
            
219
      "vocabulary_id": null
            
220
    },
            
221
    {
            
222
      "display_name": "bottom community",
            
223
      "id": "690b4d80-621f-4861-8e21-fab7445f3365",
            
224
      "name": "bottom community",
            
218
      "state": "active",
225
      "state": "active",
            
219
      "vocabulary_id": null
226
      "vocabulary_id": null
            
220
    }
227
    }
            
221
  ],
228
  ],
            
222
  "title": "Seawater carbonate chemistry and abundance of 
229
  "title": "Seawater carbonate chemistry and abundance of 
            
223
cyanobacterial, micro-algal 16S rRNAA",
230
cyanobacterial, micro-algal 16S rRNAA",
            
224
  "type": "vdataset",
231
  "type": "vdataset",
            
225
  "url": "https://doi.org/10.1594/PANGAEA.956023"
232
  "url": "https://doi.org/10.1594/PANGAEA.956023"
            
226
}
233
}