Changes

              
    

          
          
        
        

            
f
1
{
f
1
{
            
2
  "author": "Bernal, Ainhoa",
2
  "author": "Bernal, Ainhoa",
            
3
  "author_email": "",
3
  "author_email": "",
            
4
  "citation": [],
4
  "citation": [],
            
5
  "creator_user_id": "17755db4-395a-4b3b-ac09-e8e3484ca700",
5
  "creator_user_id": "17755db4-395a-4b3b-ac09-e8e3484ca700",
            
6
  "doi": "10.1594/PANGAEA.928703",
6
  "doi": "10.1594/PANGAEA.928703",
            
7
  "doi_date_published": "2021",
7
  "doi_date_published": "2021",
            
8
  "doi_publisher": "",
8
  "doi_publisher": "",
            
9
  "doi_status": "True",
9
  "doi_status": "True",
            
10
  "extra_authors": [
10
  "extra_authors": [
            
11
    {
11
    {
            
12
      "extra_author": "Vi\u00f1as, Jordi",
12
      "extra_author": "Vi\u00f1as, Jordi",
            
13
      "familyName": "Vi\u00f1as",
13
      "familyName": "Vi\u00f1as",
            
14
      "givenName": "Jordi",
14
      "givenName": "Jordi",
            
15
      "orcid": ""
15
      "orcid": ""
            
16
    },
16
    },
            
17
    {
17
    {
            
18
      "extra_author": "Olivar, M Pilar",
18
      "extra_author": "Olivar, M Pilar",
            
19
      "familyName": "Olivar",
19
      "familyName": "Olivar",
            
20
      "givenName": "M Pilar",
20
      "givenName": "M Pilar",
            
21
      "orcid": "0000-0002-8887-9181"
21
      "orcid": "0000-0002-8887-9181"
            
22
    }
22
    }
            
23
  ],
23
  ],
            
24
  "familyName": "Bernal",
24
  "familyName": "Bernal",
            
25
  "givenName": "Ainhoa",
25
  "givenName": "Ainhoa",
            
26
  "groups": [],
26
  "groups": [],
            
27
  "id": "709aebe4-72b7-41ab-b2e3-8d08cb4ac9db",
27
  "id": "709aebe4-72b7-41ab-b2e3-8d08cb4ac9db",
            
28
  "isopen": false,
28
  "isopen": false,
            
29
  "license_id": "CC-BY-4.0",
29
  "license_id": "CC-BY-4.0",
            
30
  "license_title": "CC-BY-4.0",
30
  "license_title": "CC-BY-4.0",
            
31
  "metadata_created": "2024-11-29T11:46:38.322787",
31
  "metadata_created": "2024-11-29T11:46:38.322787",
            
n
32
  "metadata_modified": "2024-11-29T11:46:38.322792",
n
32
  "metadata_modified": "2024-11-30T11:53:36.370252",
            
33
  "name": "png-doi-10-1594-pangaea-928703",
33
  "name": "png-doi-10-1594-pangaea-928703",
            
34
  "notes": "Mesopelagic fishes experience an extreme body 
34
  "notes": "Mesopelagic fishes experience an extreme body 
            
35
transformation from larvae to adults. DNA barcoding has been useful in 
35
transformation from larvae to adults. DNA barcoding has been useful in 
            
36
establishing phylogenetic relationships among mesopelagic and other 
36
establishing phylogenetic relationships among mesopelagic and other 
            
37
deep-sea fishes, however no molecular evidence to confirm the identity 
37
deep-sea fishes, however no molecular evidence to confirm the identity 
            
38
of their larvae was available so far. Molecular analyses were 
38
of their larvae was available so far. Molecular analyses were 
            
39
conducted to identify the larvae and adults of 18 species of the most 
39
conducted to identify the larvae and adults of 18 species of the most 
            
40
abundant and frequent mesopelagic fishes in the western Mediterranean, 
40
abundant and frequent mesopelagic fishes in the western Mediterranean, 
            
41
across 14 genera. For myctophids, 7 of 9 species of the subfamily 
41
across 14 genera. For myctophids, 7 of 9 species of the subfamily 
            
42
Lampanyctinae and all species from Myctophinae (6) were analysed. At 
42
Lampanyctinae and all species from Myctophinae (6) were analysed. At 
            
43
least 565 nucleotides of the mtDNA CO1 region were sequenced. The 12S 
43
least 565 nucleotides of the mtDNA CO1 region were sequenced. The 12S 
            
44
rRNA region was selected for C. braueri and C. pygmaea (372 
44
rRNA region was selected for C. braueri and C. pygmaea (372 
            
45
nucleotides). Pairwise nucleotide distances were notably higher inter- 
45
nucleotides). Pairwise nucleotide distances were notably higher inter- 
            
46
than intraspecifically allowing to discern between congeners such as 
46
than intraspecifically allowing to discern between congeners such as 
            
47
Cyclothone braueri and C. pygmaea, Hygophum benoiti and H. hygomii, 
47
Cyclothone braueri and C. pygmaea, Hygophum benoiti and H. hygomii, 
            
48
Lampanyctus crocodilus and L. pusillus, and Notoscopelus bolini and N. 
48
Lampanyctus crocodilus and L. pusillus, and Notoscopelus bolini and N. 
            
49
elongatus. The good fit between larvae and adult sequences for each 
49
elongatus. The good fit between larvae and adult sequences for each 
            
50
species proved the accuracy of earlier larval descriptions based on 
50
species proved the accuracy of earlier larval descriptions based on 
            
51
morphology and pigmentation characters. A list of the genetic markers 
51
morphology and pigmentation characters. A list of the genetic markers 
            
52
used to identify each species with their accession numbers in Genbank 
52
used to identify each species with their accession numbers in Genbank 
            
53
is provided here along with their developmental stage, sampling 
53
is provided here along with their developmental stage, sampling 
            
54
location and depth.",
54
location and depth.",
            
55
  "num_resources": 0,
55
  "num_resources": 0,
            
n
56
  "num_tags": 6,
n
56
  "num_tags": 7,
            
57
  "orcid": "0000-0001-8321-1919",
57
  "orcid": "0000-0001-8321-1919",
            
58
  "organization": {
58
  "organization": {
            
59
    "approval_status": "approved",
59
    "approval_status": "approved",
            
n
60
    "created": "2024-11-29T11:32:00.143130",
n
60
    "created": "2024-11-30T11:33:58.986659",
            
61
    "description": "PANGAEA (Data Publisher for Earth & Environmental 
61
    "description": "PANGAEA (Data Publisher for Earth & Environmental 
            
62
Science): The information system PANGAEA is operated as an Open Access 
62
Science): The information system PANGAEA is operated as an Open Access 
            
63
library aimed at archiving, publishing and distributing georeferenced 
63
library aimed at archiving, publishing and distributing georeferenced 
            
64
data from earth system research. PANGAEA guarantees long-term 
64
data from earth system research. PANGAEA guarantees long-term 
            
65
availability (greater than 10 years) of its content. PANGAEA is open 
65
availability (greater than 10 years) of its content. PANGAEA is open 
            
66
to any project, institution, or individual scientist to use or to 
66
to any project, institution, or individual scientist to use or to 
            
67
archive and publish data. PANGAEA focuses on georeferenced 
67
archive and publish data. PANGAEA focuses on georeferenced 
            
68
observational data, experimental data, and models/simulations. 
68
observational data, experimental data, and models/simulations. 
            
69
Citability, comprehensive metadata descriptions, interoperability of 
69
Citability, comprehensive metadata descriptions, interoperability of 
            
70
data and metadata, a high degree of structural and semantic 
70
data and metadata, a high degree of structural and semantic 
            
71
harmonization of the data inventory as well as the commitment of the 
71
harmonization of the data inventory as well as the commitment of the 
            
72
hosting institutions ensures FAIRness of archived data.",
72
hosting institutions ensures FAIRness of archived data.",
            
n
73
    "id": "3226ef9c-20d1-43fd-ba8f-fa35c8c9fb5d",
n
73
    "id": "ce65c98e-83d7-4b4f-9db3-99759a987d6c",
            
74
    "image_url": "pangaea_topicbiosphere.png",
74
    "image_url": "pangaea_topicoceans.png",
            
75
    "is_organization": true,
75
    "is_organization": true,
            
n
76
    "name": "pangaea_biosphere",
n
76
    "name": "pangaea_oceans",
            
77
    "state": "active",
77
    "state": "active",
            
n
78
    "title": "PANGAEA (Biosphere)",
n
78
    "title": "PANGAEA (Oceans)",
            
79
    "type": "organization"
79
    "type": "organization"
            
80
  },
80
  },
            
n
81
  "owner_org": "3226ef9c-20d1-43fd-ba8f-fa35c8c9fb5d",
n
81
  "owner_org": "ce65c98e-83d7-4b4f-9db3-99759a987d6c",
            
82
  "private": false,
82
  "private": false,
            
83
  "publication_year": "2021",
83
  "publication_year": "2021",
            
84
  "related_identifiers": [
84
  "related_identifiers": [
            
85
    {
85
    {
            
86
      "authors": "Bernal Ainhoa,Vi\u00f1as Jordi,Olivar M 
86
      "authors": "Bernal Ainhoa,Vi\u00f1as Jordi,Olivar M 
            
87
Pilar,Massuti Enric,UTM-CSIC ",
87
Pilar,Massuti Enric,UTM-CSIC ",
            
88
      "email_authors": 
88
      "email_authors": 
            
89
"bernal@icm.csic.es,,polivar@icm.csic.es,enric.massuti@ba.ieo.es,",
89
"bernal@icm.csic.es,,polivar@icm.csic.es,enric.massuti@ba.ieo.es,",
            
90
      "identifier": "https://doi.org/10.3989/scimar.04072.27A",
90
      "identifier": "https://doi.org/10.3989/scimar.04072.27A",
            
91
      "identifier_type": "DOI",
91
      "identifier_type": "DOI",
            
92
      "orcid_authors": "0000-0001-8321-1919,,0000-0002-8887-9181,,",
92
      "orcid_authors": "0000-0001-8321-1919,,0000-0002-8887-9181,,",
            
93
      "relation_type": "References",
93
      "relation_type": "References",
            
94
      "source": "Scientia Marina",
94
      "source": "Scientia Marina",
            
95
      "title": "Genetic support for the morphological identification 
95
      "title": "Genetic support for the morphological identification 
            
96
of larvae of Myctophidae, Gonostomatidae, Sternoptychidae and 
96
of larvae of Myctophidae, Gonostomatidae, Sternoptychidae and 
            
97
Phosichthyidae (Pisces) from the western Mediterranean",
97
Phosichthyidae (Pisces) from the western Mediterranean",
            
98
      "year": "2014"
98
      "year": "2014"
            
99
    },
99
    },
            
100
    {
100
    {
            
101
      "authors": "Bernal Ainhoa,Vi\u00f1as Jordi,Olivar M 
101
      "authors": "Bernal Ainhoa,Vi\u00f1as Jordi,Olivar M 
            
102
Pilar,Massuti Enric,UTM-CSIC ",
102
Pilar,Massuti Enric,UTM-CSIC ",
            
103
      "email_authors": 
103
      "email_authors": 
            
104
"bernal@icm.csic.es,,polivar@icm.csic.es,enric.massuti@ba.ieo.es,",
104
"bernal@icm.csic.es,,polivar@icm.csic.es,enric.massuti@ba.ieo.es,",
            
105
      "identifier": "https://doi.org/10.20351/29SG20100712",
105
      "identifier": "https://doi.org/10.20351/29SG20100712",
            
106
      "identifier_type": "DOI",
106
      "identifier_type": "DOI",
            
107
      "orcid_authors": "0000-0001-8321-1919,,0000-0002-8887-9181,,",
107
      "orcid_authors": "0000-0001-8321-1919,,0000-0002-8887-9181,,",
            
108
      "relation_type": "References",
108
      "relation_type": "References",
            
109
      "source": "UTM-CSIC",
109
      "source": "UTM-CSIC",
            
110
      "title": "IDEADOS-10 Cruise, RV Sarmiento de Gamboa",
110
      "title": "IDEADOS-10 Cruise, RV Sarmiento de Gamboa",
            
111
      "year": "2018"
111
      "year": "2018"
            
112
    }
112
    }
            
113
  ],
113
  ],
            
114
  "relationships_as_object": [],
114
  "relationships_as_object": [],
            
115
  "relationships_as_subject": [],
115
  "relationships_as_subject": [],
            
116
  "repository_name": "PANGAEA (Data Publisher for Earth & 
116
  "repository_name": "PANGAEA (Data Publisher for Earth & 
            
117
Environmental Science)",
117
Environmental Science)",
            
118
  "resource_type": "text/tab-separated-values - filename: 
118
  "resource_type": "text/tab-separated-values - filename: 
            
119
Bernal-etal_2021",
119
Bernal-etal_2021",
            
120
  "resources": [],
120
  "resources": [],
            
121
  "source_metadata_created": "2021",
121
  "source_metadata_created": "2021",
            
122
  "source_metadata_modified": "",
122
  "source_metadata_modified": "",
            
123
  "state": "active",
123
  "state": "active",
            
124
  "subject_areas": [
124
  "subject_areas": [
            
125
    {
125
    {
            
126
      "subject_area_additional": "",
126
      "subject_area_additional": "",
            
127
      "subject_area_name": "Biosphere"
127
      "subject_area_name": "Biosphere"
            
128
    },
128
    },
            
129
    {
129
    {
            
130
      "subject_area_additional": "",
130
      "subject_area_additional": "",
            
131
      "subject_area_name": "Oceans"
131
      "subject_area_name": "Oceans"
            
132
    }
132
    }
            
133
  ],
133
  ],
            
134
  "tags": [
134
  "tags": [
            
135
    {
135
    {
            
136
      "display_name": "12S ribosomal ribonucleic acid",
136
      "display_name": "12S ribosomal ribonucleic acid",
            
137
      "id": "36ce5598-9060-4a59-89bb-999392d3862e",
137
      "id": "36ce5598-9060-4a59-89bb-999392d3862e",
            
138
      "name": "12S ribosomal ribonucleic acid",
138
      "name": "12S ribosomal ribonucleic acid",
            
139
      "state": "active",
139
      "state": "active",
            
140
      "vocabulary_id": null
140
      "vocabulary_id": null
            
141
    },
141
    },
            
142
    {
142
    {
            
n
143
      "display_name": "DNA-barcoding",
n
143
      "display_name": "DNA",
            
144
      "id": "7a6d7878-0bd6-4b17-983e-e8248712ff42",
144
      "id": "5677a07c-33fa-4e10-9efe-b61f82ec690c",
            
145
      "name": "DNA-barcoding",
145
      "name": "DNA",
            
146
      "state": "active",
146
      "state": "active",
            
147
      "vocabulary_id": null
147
      "vocabulary_id": null
            
148
    },
148
    },
            
149
    {
149
    {
            
150
      "display_name": "Western Mediterranean Sea",
150
      "display_name": "Western Mediterranean Sea",
            
151
      "id": "919c24de-b0ff-4ef6-a33a-9464a8545b18",
151
      "id": "919c24de-b0ff-4ef6-a33a-9464a8545b18",
            
152
      "name": "Western Mediterranean Sea",
152
      "name": "Western Mediterranean Sea",
            
t
t
153
      "state": "active",
            
154
      "vocabulary_id": null
            
155
    },
            
156
    {
            
157
      "display_name": "barcoding",
            
158
      "id": "ae2803ce-c853-4e6d-8af2-fce56bfcdfad",
            
159
      "name": "barcoding",
            
153
      "state": "active",
160
      "state": "active",
            
154
      "vocabulary_id": null
161
      "vocabulary_id": null
            
155
    },
162
    },
            
156
    {
163
    {
            
157
      "display_name": "cytochrome c oxidase subunit 1",
164
      "display_name": "cytochrome c oxidase subunit 1",
            
158
      "id": "8cda196a-a68f-44ce-8de5-8497647f4fb9",
165
      "id": "8cda196a-a68f-44ce-8de5-8497647f4fb9",
            
159
      "name": "cytochrome c oxidase subunit 1",
166
      "name": "cytochrome c oxidase subunit 1",
            
160
      "state": "active",
167
      "state": "active",
            
161
      "vocabulary_id": null
168
      "vocabulary_id": null
            
162
    },
169
    },
            
163
    {
170
    {
            
164
      "display_name": "larval identification",
171
      "display_name": "larval identification",
            
165
      "id": "facd4879-5206-419a-841a-fae8154594dc",
172
      "id": "facd4879-5206-419a-841a-fae8154594dc",
            
166
      "name": "larval identification",
173
      "name": "larval identification",
            
167
      "state": "active",
174
      "state": "active",
            
168
      "vocabulary_id": null
175
      "vocabulary_id": null
            
169
    },
176
    },
            
170
    {
177
    {
            
171
      "display_name": "mesopelagic fish",
178
      "display_name": "mesopelagic fish",
            
172
      "id": "79495a04-9c9a-4a9b-b373-e604f3e45324",
179
      "id": "79495a04-9c9a-4a9b-b373-e604f3e45324",
            
173
      "name": "mesopelagic fish",
180
      "name": "mesopelagic fish",
            
174
      "state": "active",
181
      "state": "active",
            
175
      "vocabulary_id": null
182
      "vocabulary_id": null
            
176
    }
183
    }
            
177
  ],
184
  ],
            
178
  "title": "Genetic support for the morphological identification of 
185
  "title": "Genetic support for the morphological identification of 
            
179
larvae of Myctophidae, Gonostomatidae, Sternoptychidae and 
186
larvae of Myctophidae, Gonostomatidae, Sternoptychidae and 
            
180
Phosichthyidae (Pisces) from the western Mediterranean",
187
Phosichthyidae (Pisces) from the western Mediterranean",
            
181
  "type": "vdataset",
188
  "type": "vdataset",
            
182
  "url": "https://doi.org/10.1594/PANGAEA.928703"
189
  "url": "https://doi.org/10.1594/PANGAEA.928703"
            
183
}
190
}