Changes

              
    

          
          
        
        

            
f
1
{
f
1
{
            
2
  "author": "Feiner, Alexander",
2
  "author": "Feiner, Alexander",
            
3
  "author_email": "",
3
  "author_email": "",
            
4
  "creator_user_id": "17755db4-395a-4b3b-ac09-e8e3484ca700",
4
  "creator_user_id": "17755db4-395a-4b3b-ac09-e8e3484ca700",
            
5
  "doi": "10.22000/319",
5
  "doi": "10.22000/319",
            
6
  "doi_date_published": "2020",
6
  "doi_date_published": "2020",
            
7
  "doi_publisher": "",
7
  "doi_publisher": "",
            
8
  "doi_status": "True",
8
  "doi_status": "True",
            
9
  "extra_authors": [
9
  "extra_authors": [
            
10
    {
10
    {
            
11
      "extra_author": "Pitra, Nicholi",
11
      "extra_author": "Pitra, Nicholi",
            
12
      "orcid": "0000-0001-8642-5138"
12
      "orcid": "0000-0001-8642-5138"
            
13
    },
13
    },
            
14
    {
14
    {
            
15
      "extra_author": "Matthews, Paul",
15
      "extra_author": "Matthews, Paul",
            
16
      "orcid": ""
16
      "orcid": ""
            
17
    },
17
    },
            
18
    {
18
    {
            
19
      "extra_author": "Pillen, Klaus",
19
      "extra_author": "Pillen, Klaus",
            
20
      "orcid": ""
20
      "orcid": ""
            
21
    },
21
    },
            
22
    {
22
    {
            
23
      "extra_author": "Wessjohann, Ludger A.",
23
      "extra_author": "Wessjohann, Ludger A.",
            
24
      "orcid": "0000-0003-2060-8235"
24
      "orcid": "0000-0003-2060-8235"
            
25
    },
25
    },
            
26
    {
26
    {
            
27
      "extra_author": "Riewe, David",
27
      "extra_author": "Riewe, David",
            
28
      "orcid": "0000-0002-9095-5518"
28
      "orcid": "0000-0002-9095-5518"
            
29
    }
29
    }
            
30
  ],
30
  ],
            
31
  "groups": [],
31
  "groups": [],
            
32
  "id": "aadf20e9-6251-440b-ac9d-550737e93140",
32
  "id": "aadf20e9-6251-440b-ac9d-550737e93140",
            
33
  "isopen": false,
33
  "isopen": false,
            
34
  "license_id": "CC BY 4.0 Attribution",
34
  "license_id": "CC BY 4.0 Attribution",
            
35
  "license_title": "CC BY 4.0 Attribution",
35
  "license_title": "CC BY 4.0 Attribution",
            
36
  "metadata_created": "2023-01-12T13:30:28.386448",
36
  "metadata_created": "2023-01-12T13:30:28.386448",
            
t
37
  "metadata_modified": "2023-08-04T08:51:20.180596",
t
37
  "metadata_modified": "2023-08-04T08:52:48.027427",
            
38
  "name": "rdr-doi-10-22000-319",
38
  "name": "rdr-doi-10-22000-319",
            
39
  "notes": "Abstract: Downy mildew in hop (Humulus lupulus L.) is 
39
  "notes": "Abstract: Downy mildew in hop (Humulus lupulus L.) is 
            
40
caused by Pseudoperonospora humuli and generates significant losses in 
40
caused by Pseudoperonospora humuli and generates significant losses in 
            
41
quality and yield. To identify the biochemical processes that confer 
41
quality and yield. To identify the biochemical processes that confer 
            
42
natural downy mildew resistance (DMR), a metabolome- and genome-wide 
42
natural downy mildew resistance (DMR), a metabolome- and genome-wide 
            
43
association study was performed. Inoculation of a high density 
43
association study was performed. Inoculation of a high density 
            
44
genotyped F1 hop population (n=192) with the obligate biotrophic 
44
genotyped F1 hop population (n=192) with the obligate biotrophic 
            
45
oomycete P. humuli led to variation in both the levels of thousands of 
45
oomycete P. humuli led to variation in both the levels of thousands of 
            
46
specialized metabolites and DMR. We observed that metabolites of 
46
specialized metabolites and DMR. We observed that metabolites of 
            
47
almost all major phytochemical classes were induced 48 hours after 
47
almost all major phytochemical classes were induced 48 hours after 
            
48
inoculation. But only a small number of metabolites were found to be 
48
inoculation. But only a small number of metabolites were found to be 
            
49
correlated with DMR and these were enriched with phenylpropanoids. 
49
correlated with DMR and these were enriched with phenylpropanoids. 
            
50
These metabolites were also correlated with DMR when measured from the 
50
These metabolites were also correlated with DMR when measured from the 
            
51
non-infected control set. A genome-wide association study revealed 
51
non-infected control set. A genome-wide association study revealed 
            
52
co-localization of the major DMR loci and the phenylpropanoid pathway 
52
co-localization of the major DMR loci and the phenylpropanoid pathway 
            
53
markers indicating that the major contribution to resistance is 
53
markers indicating that the major contribution to resistance is 
            
54
mediated by these metabolites in a heritable manner. The application 
54
mediated by these metabolites in a heritable manner. The application 
            
55
of three putative prophylactic phenylpropanoids led to a reduced 
55
of three putative prophylactic phenylpropanoids led to a reduced 
            
56
degree of leaf infection in susceptible genotypes, confirming their 
56
degree of leaf infection in susceptible genotypes, confirming their 
            
57
protective activity either directly or as precursors of active 
57
protective activity either directly or as precursors of active 
            
58
compounds.",
58
compounds.",
            
59
  "num_resources": 0,
59
  "num_resources": 0,
            
60
  "num_tags": 6,
60
  "num_tags": 6,
            
61
  "orcid": "0000-0001-6564-8826",
61
  "orcid": "0000-0001-6564-8826",
            
62
  "organization": {
62
  "organization": {
            
63
    "approval_status": "approved",
63
    "approval_status": "approved",
            
64
    "created": "2023-01-12T13:30:23.238233",
64
    "created": "2023-01-12T13:30:23.238233",
            
65
    "description": "RADAR (Research Data Repository) is a 
65
    "description": "RADAR (Research Data Repository) is a 
            
66
cross-disciplinary repository for archiving and publishing research 
66
cross-disciplinary repository for archiving and publishing research 
            
67
data from completed scientific studies and projects. The focus is on 
67
data from completed scientific studies and projects. The focus is on 
            
68
research data from subjects that do not yet have their own 
68
research data from subjects that do not yet have their own 
            
69
discipline-specific infrastructures for research data management. ",
69
discipline-specific infrastructures for research data management. ",
            
70
    "id": "013c89a9-383c-4200-8baa-0f78bf1d91f9",
70
    "id": "013c89a9-383c-4200-8baa-0f78bf1d91f9",
            
71
    "image_url": "radar-logo.svg",
71
    "image_url": "radar-logo.svg",
            
72
    "is_organization": true,
72
    "is_organization": true,
            
73
    "name": "radar",
73
    "name": "radar",
            
74
    "state": "active",
74
    "state": "active",
            
75
    "title": "RADAR",
75
    "title": "RADAR",
            
76
    "type": "organization"
76
    "type": "organization"
            
77
  },
77
  },
            
78
  "owner_org": "013c89a9-383c-4200-8baa-0f78bf1d91f9",
78
  "owner_org": "013c89a9-383c-4200-8baa-0f78bf1d91f9",
            
79
  "private": false,
79
  "private": false,
            
80
  "production_year": "2015",
80
  "production_year": "2015",
            
81
  "publication_year": "2020",
81
  "publication_year": "2020",
            
82
  "publishers": [
82
  "publishers": [
            
83
    {
83
    {
            
84
      "publisher": "Simon H. Steiner, Hopfen, GmbH, Mainburg, Germany"
84
      "publisher": "Simon H. Steiner, Hopfen, GmbH, Mainburg, Germany"
            
85
    },
85
    },
            
86
    {
86
    {
            
87
      "publisher": "Leibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plant 
87
      "publisher": "Leibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plant 
            
88
Research (IPK), Gatersleben, Germany"
88
Research (IPK), Gatersleben, Germany"
            
89
    },
89
    },
            
90
    {
90
    {
            
91
      "publisher": "Julius Kuehn-Institute (JKI), Berlin, Germany"
91
      "publisher": "Julius Kuehn-Institute (JKI), Berlin, Germany"
            
92
    },
92
    },
            
93
    {
93
    {
            
94
      "publisher": "Leibniz Institute of Plant Biochemistry (IPB), 
94
      "publisher": "Leibniz Institute of Plant Biochemistry (IPB), 
            
95
Halle (Saale), Germany"
95
Halle (Saale), Germany"
            
96
    }
96
    }
            
97
  ],
97
  ],
            
98
  "relationships_as_object": [],
98
  "relationships_as_object": [],
            
99
  "relationships_as_subject": [],
99
  "relationships_as_subject": [],
            
100
  "repository_name": "RADAR (Research Data Repository)",
100
  "repository_name": "RADAR (Research Data Repository)",
            
101
  "resource_type": "Dataset - MS Peak table",
101
  "resource_type": "Dataset - MS Peak table",
            
102
  "resources": [],
102
  "resources": [],
            
103
  "services_used_list": "",
103
  "services_used_list": "",
            
104
  "source_metadata_created": "2020",
104
  "source_metadata_created": "2020",
            
105
  "source_metadata_modified": "",
105
  "source_metadata_modified": "",
            
106
  "state": "active",
106
  "state": "active",
            
107
  "subject_areas": [
107
  "subject_areas": [
            
108
    {
108
    {
            
109
      "subject_area_additional": "",
109
      "subject_area_additional": "",
            
110
      "subject_area_name": "Biochemistry"
110
      "subject_area_name": "Biochemistry"
            
111
    },
111
    },
            
112
    {
112
    {
            
113
      "subject_area_additional": "",
113
      "subject_area_additional": "",
            
114
      "subject_area_name": "Agriculture"
114
      "subject_area_name": "Agriculture"
            
115
    }
115
    }
            
116
  ],
116
  ],
            
117
  "tags": [
117
  "tags": [
            
118
    {
118
    {
            
119
      "display_name": "downy mildew resistance",
119
      "display_name": "downy mildew resistance",
            
120
      "id": "eb00d134-acff-407d-9361-307bcc40f1e7",
120
      "id": "eb00d134-acff-407d-9361-307bcc40f1e7",
            
121
      "name": "downy mildew resistance",
121
      "name": "downy mildew resistance",
            
122
      "state": "active",
122
      "state": "active",
            
123
      "vocabulary_id": null
123
      "vocabulary_id": null
            
124
    },
124
    },
            
125
    {
125
    {
            
126
      "display_name": "genome-wide association study",
126
      "display_name": "genome-wide association study",
            
127
      "id": "e0e5c774-d57a-435e-8418-e86330b7f7a0",
127
      "id": "e0e5c774-d57a-435e-8418-e86330b7f7a0",
            
128
      "name": "genome-wide association study",
128
      "name": "genome-wide association study",
            
129
      "state": "active",
129
      "state": "active",
            
130
      "vocabulary_id": null
130
      "vocabulary_id": null
            
131
    },
131
    },
            
132
    {
132
    {
            
133
      "display_name": "hop",
133
      "display_name": "hop",
            
134
      "id": "e2a218b7-02e0-460b-941e-69da131b30aa",
134
      "id": "e2a218b7-02e0-460b-941e-69da131b30aa",
            
135
      "name": "hop",
135
      "name": "hop",
            
136
      "state": "active",
136
      "state": "active",
            
137
      "vocabulary_id": null
137
      "vocabulary_id": null
            
138
    },
138
    },
            
139
    {
139
    {
            
140
      "display_name": "oomycete",
140
      "display_name": "oomycete",
            
141
      "id": "3a5b9fd3-a0ba-40e7-bf52-bb5d2421de10",
141
      "id": "3a5b9fd3-a0ba-40e7-bf52-bb5d2421de10",
            
142
      "name": "oomycete",
142
      "name": "oomycete",
            
143
      "state": "active",
143
      "state": "active",
            
144
      "vocabulary_id": null
144
      "vocabulary_id": null
            
145
    },
145
    },
            
146
    {
146
    {
            
147
      "display_name": "phenylpropanoids",
147
      "display_name": "phenylpropanoids",
            
148
      "id": "74603eb2-37cc-4f92-bfc8-a0dcb3630b1c",
148
      "id": "74603eb2-37cc-4f92-bfc8-a0dcb3630b1c",
            
149
      "name": "phenylpropanoids",
149
      "name": "phenylpropanoids",
            
150
      "state": "active",
150
      "state": "active",
            
151
      "vocabulary_id": null
151
      "vocabulary_id": null
            
152
    },
152
    },
            
153
    {
153
    {
            
154
      "display_name": "untargeted metabolomics",
154
      "display_name": "untargeted metabolomics",
            
155
      "id": "cfd280db-a29d-4fdb-bcf9-0f5d31e0f746",
155
      "id": "cfd280db-a29d-4fdb-bcf9-0f5d31e0f746",
            
156
      "name": "untargeted metabolomics",
156
      "name": "untargeted metabolomics",
            
157
      "state": "active",
157
      "state": "active",
            
158
      "vocabulary_id": null
158
      "vocabulary_id": null
            
159
    }
159
    }
            
160
  ],
160
  ],
            
161
  "title": "Supplementary data for \"downy mildew resistance is 
161
  "title": "Supplementary data for \"downy mildew resistance is 
            
162
genetically mediated by prophylactic production of phenylpropanoids in 
162
genetically mediated by prophylactic production of phenylpropanoids in 
            
163
hop\"",
163
hop\"",
            
164
  "type": "vdataset",
164
  "type": "vdataset",
            
165
  "url": "https://doi.org/10.22000/319"
165
  "url": "https://doi.org/10.22000/319"
            
166
}
166
}